Adobe Photoshop : The Surprise Scientific Image Processing Software of Choice ? Photoshop uses in medical research

　　说到用于科学实验室和显微镜利用方面的图象处理软件，一般集中在图象分析软件包的性能上。但在软件选择和使用的实际中，决不仅仅是这一个方面的问题。

　　一个新的趋势是显微术在图象处理中的应用：Adobe Photoshop的使用，是作为常规图象处理的助手或是代替品。

　　在美国，一家服务于显微术和相关图象领域的科技营销公司，通过对美国细胞生物学会和M&M学会（显微术研究学会及微光束分析学会）等主要行业的几年的研究，已经对这个趋势进行了几年的跟踪。

Photoshop的使用接近90%
　　这篇文章的目的当然不是要对某种特殊的软件程序做一次预览。Photoshop迅速的和广范围的流传使人始料不及，可它却一点都不引人注目。

　　随着科技的发展，学术界和先进的国家实验室的情况是：大约80%的专业论文使用了Photoshop，90%的毕业生也使用了这个软件。

　　本年度M&M的数字表明，实验室管理人员的使用（90%），较M&M 99年的84%及细胞生物学会98年的80%都有增长，研究者对其的使用在过去的一年也有显著的增长——达到了80%。

　　工业设备在今年也出现了重大的增长，从99年的63%到75%。研究中临床实验室的数据还不足以形成统计的有效意见。M&M会议上基于规律的分析显示了生物学家和材料科学家的意见有微小的差别。生物学家们认为有90%的使用率，而材料学家们则认为99年跟2000年都在77%左右。

他们到底在做什么？
　　虽然Photoshop是为形象艺术和普通数字摄像设计的，它的一些主要功能在科学领域里也有很好的应用。

　　比如，对照是显微术上的一个难点。我们通常不得不把隐藏信息拖到隐蔽处或加亮区。Photoshop在进行对比方面是一个很好的工具。如果草案中包括有图象分析的部分，在用Photoshop处理之前，先进行测量，以维持科学内容的有效性。

　　此外，由于很多显微图象都是用于展示的，或是出版或是专业会议上的招贴画，注解是很重要的。正象下面讲到的，Photoshop的层压功能可以把附加的文字、箭头以及标尺放在一个独立的层内，并且可以在不影响图象的前提下对其进行独立修改。

　　第三个关键功能是图象的缩放。大多数出版社有他们特殊的长宽要求，及每英寸150行的分辨率（相当于每英寸300点或象素的分辨率）。Photoshop可以轻而易举地进行缩放和调整。用Photoshop对图象的品质和文件大小进行修改是很有趣的过程。重要的是，如果你对图象的分辨率进行改动，点“resampling”键以保持图象的大小。

　　Photoshop还有“批处理”功能对图象组进行处理，这对图象压缩来讲节省了大量的时间。有人说TIFF是唯一获得美国显微术学会正式批准的图象格式。对TIFF图象，Photoshop提供LZW压缩功能以供选择，这种功能可以通过无损运算而保持图象的完整性。另外，多重图象可以混合成一个更大的图象。

　　最后，对那些寻找简单便宜的图象分析软件的人们，使用带插件(plug-ins)的Photoshop也是很好的选择。

层压法：Photoshop成功的一个秘密所在
　　长期的实践表明Photoshop 的两个长处是层压法和色彩平衡。

　　层压法是把一幅图象分成不连续的图象平面以进行单独处理。正如前面提到的，对注解和图象标尺来说，这是一个很好的方法。而且，立体照片可以独立着色（红/绿，红/蓝等）而不用分层进行。

秘密：设计到设计的色彩平衡
　　获知如何平衡从相机到显示器到打印机的色彩输出，是关键问题。由于数字成像涉及很多因素，要确切再现在显微镜下看到的图象的确有些困难。Photoshop的色彩管理功能把显示器、终端的使用（网页、展示、印前）、色彩体系（RGB和CMYK）、图象模式（浅显微镜会选择全彩色，而SEM，激光扫描共焦和AFM的使用者会选择两色网版或是点彩色），甚至打印机的品牌和型号都考虑在内。我们的建议是：以一个状况良好的例子为开始，然后可以操作色彩更微妙的、更难些的样本。

ADOBE在学界的成就
　　在Photoshop6.0版本中增添了更多的网络功能，包括将文本转化为PDF格式，以及可以生成用于网络的图象的Adobe ReadyImage功能。

　　此外具有吸引力的价格确保了这款软件迅速而广泛地流行开来。

旗鼓相当的争辩
　　肯定的一方认为，Photoshop可以处理16比特的黑白和彩色图象，支持各种类型的文件格式，而且使麻烦的MAC图象到PC的转换变得方便了。而且，一旦熟悉了它的主要功能，它的菜单就显得清楚而简单。事实上，Photoshop提供了前所未有的更多的性能。

　　反面的一方认为，有的人可能会觉得这是一件有好处也有坏处的事情。由于很轻易就可以进行图象的处理，虽然会得到质量更好的画面，但也有可能会导致科学的有效性的严重丢失。另外，整个的程序并不直观，仍然需要深入的研究，虽然这个软件的连续版本已经对这一部分有了相当多的关注。类似MME的课程是一种解决方案，它提供把Photoshop的主要功能和科学成像概念结合在一起的程序，在实际操作中把任何缺点都减少到最小。

对科学道德的一点看法
　　在任何图象处理中，使用Photoshop都增加了一些评论问题。传统科学规定，对图象的任何修改都要在对方法进行讨论的基础上。并且，始终将原始图象以TIFF文件保存。（最近无意中听到的一个意见说：把原始图象存一个文件，用Photoshop处理过的另存一个文件）。也有人认为测量应该在处理之前，因为处理过程可能对测量的参数有影响。

　　最后，对图象处理有个提醒：其内在的科学信息可能被改变或错误叙述。面对好多实验方法，即使是一个小的预见，也要经过长时间的检验